Os docentes do PPM atuam como consultores ad hoc do CNPq, CAPES, Fundação Araucária; FAPESP e outras agências de fomento estaduais e de periódicos científicos nacionais e internacionais (Antimicrob. Agents Chemother., Frontiers Microbiol., Biocontrol Science and Technology, Br. J. Med. Med. Res., Diagn. Microbiol. Infect. Dis., Nature Protocols, Med. Mycol., Cell. Mol. Biol. Lett., Annals Microbiol., Food Technology and Biotechnology, Forest Ecology and Management, Exp. Parasitol., Recent Patents on DNA and Gene Sequences, Bioresource Technology, Soil Ecology and Management, J. Med. Virol., J. Virol. Methods, J. Med. Microbiol., Letters in Applied Microbiol., J. Appl. Microbiol., Fungal Ecol., J. Antibiot., The Journal of Venomous Animals and Toxins Including Tropical Diseases, APMIS. Acta Pathologica, Microbiologica et Immunologica Scandinavica, Foodborne Pathog. Dis., J. Appl. Biomed., PlosOne, Natural Product Res., Micron, Mol. Biol. Rep., J. Basic Microbiol., Chemotherapy, Ind. J. Med. Microbiol., Eur. J. Pediatrics, Braz. J. Microbiol., Pharmaceutical Biology, Sci. Rep., Antonie Van Leenwenhoek, Biofouling, Current Bionanotechnology, Epidemiol. Infect., Int. J. Biol. Macromolecules, Yeast, Curr. Bioactive Compounds, Mem. Inst. Oswaldo Cruz, Rev. Inst. Med. Trop. São Paulo, J. Food Safety, Acta Scientiarum-Biological Sciences, Rev. Bras. Ciência do Solo, Bragantia, Semina, etc.).
Os docentes do PPM participam de comissões estaduais e nacionais de órgãos de fomentos e relacionados à pesquisa científica e tecnológica, comitê PIBIC-CNPq e de corpo editorial de periódicos da área (Scientific Reports, Journal of Coastal Life Medicine, Semina: Ciências Biológicas; Frontiers in Microbiology; Evidence Based Complementary and Alternative Medicine).
Os docentes atuam também em bancas examinadoras de trabalhos de conclusão de Pós-Graduação em outras IES e outras universidades no exterior (através de videoconferência ou pessoalmente), em projetos de extensão à comunidade, além de consultoria privada e estatal na área de microbiologia ambiental.
Um docente atua como consultor da Fundação Bill & Melinda Gates para projetos de Fixação Biológica de Nitrogênio na África, bem como de projetos na Argentina e no Peru.