O Programa de Pós-Graduação em Engenharia Civil oferece anualmente até 30 vagas para alunos regulares de Mestrado e 15 para Doutorado. As vagas são preenchidas com base na disponibilidade dos docentes para orientação e no desempenho do candidato durante o processo de seleção, que ocorre uma vez por ano. As inscrições costumam ser realizadas nos meses de setembro e outubro do ano anterior ao da matrícula.
Além disso, há a opção de se inscrever como aluno especial em disciplinas do programa, tanto para mestrado quanto para doutorado. Neste caso, geralmente são publicados dois editais anuais: um no início do ano letivo e outro próximo ao início do segundo semestre. Todos os processos seletivos possuem editais específicos.
Para os alunos que podem se dedicar exclusivamente ao Programa, há a possibilidade de concessão de bolsas de fomento externo oferecidas pela Capes, CNPq e Fundação Araucária.