O Programa de Pós-graduação em Agronomia é ministrado em rede por docentes Universidade Estadual de Londrina (UEL) e Instituto de Desenvolvimento Rural do Paraná (IDR -PR). Iniciou suas atividades no ano de 2000 e atualmente é avaliado como um programa de excelência (Conceito CAPES 6) e de destacada atuação nas Ciências Agrárias regional, nacional e internacional.

O Paraná, principalmente a região Norte, onde está localizado o programa, é um dos principais polos de produção e pesquisa agrícola do Brasil, com estrutura agrária formada, predominantemente, de pequenos e médios estabelecimentos, e importante papel social de geração de emprego e renda. O agronegócio é a atividade que tem determinado a dinâmica da economia paranaense e, a região norte do estado caracteriza-se pela agricultura intensiva com elevadas produtividades e ampla adoção de tecnologias, gerando demanda constante por pesquisa, ensino e extensão, em vários níveis de capital e tecnologia.

A missão do Programa de Pós-graduação em Agronomia é a formação de profissionais de excelência, mediante capacitação técnica, científica e humanística, para atuarem nas atividades de pesquisa, ensino e extensão, em instituições públicas ou privadas, em consonância com a demanda do setor produtivo agropecuário. Faz parte ainda da missão o desenvolvimento de sistemas agrícolas sustentáveis e compatibilizados com o uso racional de insumos agrícolas visando contribuir para a promoção de uma agricultura produtiva e sustentável, atendendo um mercado consumidor exigente por produtos de qualidade e produzidos com reduzido impacto ambiental.

Além de centenas de mestres e doutores já formados e inseridos no mundo do trabalho, um grande acervo de processos e produtos já foi desenvolvido durante os mais de 20 anos de existência do Programa. Cita-se, como exemplo, o sistema de plantio direto, que teve suas raízes e expansão inicial, estabelecidos com participação efetiva de Docentes/pesquisadores do programa.

No ano de 2021 o Programa de Pós-graduação em Agronomia da UEL incorporou, por meio do processo de fusão, o programa de pós-graduação AGRICULTURA CONSERVACIONISTA do Instituto de Desenvolvimento Rural do Paraná (IDR-IAPAR). A associação UEL e IDR proporcionou ao Programa maior qualificação por meio da diversificação de corpo docente, temáticas de pesquisa, ampliação da infraestrutura laboratorial, de campo e de suporte de recursos humanos. O sinergismo desta associação reside principalmente na junção dos pontos fortes das instituições coirmãs que de longa data já atuavam em parceria.

O corpo docente é formado por 32 professores, sendo 25 permanentes e 07 colaboradores que ministram disciplinas, desenvolvem projetos de pesquisa, e orientam em Mestrado e Doutorado.  A matriz curricular apresenta uma abordagem ampla e inovadora com conceitos técnicos de manejo cultural, com intuito de proporcionar ao pós-graduando habilidades e discernimento para definir práticas adequadas a cada modelo de agricultura. Para alcançar seus objetivos, o programa está estruturado em quatro áreas de concentração: produção vegetal; melhoramento genético vegetal e biotecnologia aplicada; proteção de plantas e ciência do solo. Dentro dessas grandes áreas, as linhas de pesquisa envolvem agricultura, fisiologia vegetal, horticultura, melhoramento genético de culturas anuais, energéticas e perenes, manejo integrado de pragas, fitopatógenos de importância agrícola, manejo sustentável do solo, fertilidade do solo e nutrição de plantas, dentre outras.

Os estudos desenvolvidos pelo programa têm impactado positivamente o agronegócio e a sociedade em geral. Por isso, além da preocupação com a formação profissional e qualidade das pesquisas realizadas, o programa conecta-se com toda estrutura de assistência técnica e extensão rural. Esta rede de difusão de tecnologias permite o levantamento de demandas reais do setor produtivo, possibilitando resolver questões objetivas e emergentes. Com a disponibilidade de muitas estações experimentais em todo o Estado, é possível testar as soluções em vários locais, com condições edafoclimáticas diferenciadas.   Através desta sistemática, os pós-graduandos e o comitê de orientação validam as hipóteses formuladas, com experimentação em múltiplos locais com maior credibilidade dos resultados.  Imediatamente, as informações, processos ou produtos obtidos, tornam-se disponíveis aos agricultores através do sistema de extensão.

O Programa possui convênios que viabilizam a mobilidade nacional e internacional de estudantes e docentes, visando a capacitação. Acadêmicos de outras nacionalidades também buscam no programa aprimoramento em sistemas agrícolas tropicais e subtropicais.

Finalmente, destaca-se a vocação do Estado e, particularmente da região, no desenvolvimento e aplicação de tecnologias à atividade agrícola. Por sua situação geográfica, o Paraná proporciona o cultivo de inúmeras espécies de exploração econômica, quer sejam, mais tropicais, principalmente nas regiões Norte e Noroeste; ou mais temperadas, na região sul do Estado. Tudo isso, contando com estações experimentais para a condição dos estudos científicos. Na região de Londrina, além da UEL e IDR, várias instituições públicas e privadas estão focadas na pesquisa, produção de insumos, prestação de serviços, extensão, consultoria etc., sendo local de efervescência científica e tecnológica no setor de agricultura.  Todo esse ambiente, associado a um corpo docente e discentes comprometidos, permitem que o curso produza profissionais realmente focados em gerar soluções e formas de aplicá-las de forma a tornar a agricultura cada vez mais sustentável. Não por acaso, os profissionais capacitados pelo programa tem sido absorvidos pelo mercado de trabalho, alcançando destaque na sua atuação profissional.