O processo de autoavaliação é um instrumento para refletir e propor avanços no sentido de incrementar a formação discente, a produção do conhecimento e a sua disseminação para apropriação da sociedade. Internamente, a comissão do programa é composta pela comissão coordenadora, um membro de cada área de concentração, dois alunos (um de mestrado e outro de doutorado), um egresso e um participante externo.

Abaixo, estão os documentos que norteiam a autoavaliação em nível nacional, na universidade e no programa de pós-graduação em agronomia.