O Programa de Pós-Graduação em Ciências Fisiológicas (PGCIF) em nível de mestrado e doutorado é credenciado pela CAPES com conceito 4 e iniciou suas atividades em Março de 2019. Este Programa foi criado a partir da experiência adquirida pelo Departamento de Ciências Fisiológicas da UEL como Instituição Associada do Programa Multicêntrico de Pós-graduação em Ciências Fisiológicas (PMPGCF), o qual teve como objetivo principal promover a expansão do número de Programas de Pós-graduação na área de Ciências Fisiológicas. A experiência adquirida pelo Departamento de Ciências Fisiológicas da UEL no PMPGCF trouxe nova perspectiva de trabalho, de modo que se acreditou que o corpo docente estava amadurecido o suficiente para trilhar uma nova etapa na Pós-Graduação em Ciências Fisiológicas. E nesse sentido foi criado o Programa de Pós-Graduação em Ciências Fisiológicas do CIF, composto por 15 docentes, dos quais 13 docentes já faziam parte do PMPGCF.